Natronomonas pharaonis
Таксономия:
Империя: Cellulata,
Надцарство: Procariota,
Царство: Archaea,
Тип: Euryarchaeota,
Класс:Halobacteria,
Отряд: Halobacteriales,
Семейство: Halobacteriaceae,
Род: Natronomonas,
Вид: Natronomonas pharaonis
Natronomonas pharaonis - это аэробные чрезвычайно галоалкалифильные археи, которые интересны с точки зрения азотистого обмена. Этим объясняется значение секвенирования генома данного прокариота. Данные организмы обитают в карбонатных озерах, где им приходится иметь дело с двумя видами экстремальных условий: высокая концентрация соли и сильнощелочная реакция среды - pH=11. Эти критические условия являются причиной пониженного уровня аммиака. В соответствии с анализом генома, Natronomonas имеют три механизма, поставляющие аммонийные соединения, которые впоследствии связываются в глутаматы: направленное поглощение аммиака, потребление нитратов с последующим превращением их в аммиак и расщепление посредством уреазы мочевины до аммиака.
Название виду дал штамм Gabara (DSM 2160), который был найден в озере Габара в Египте. Этот штамм, как и все представители этого вида, имеет одну кольцевую хромосому и две. Известно, что около 63,4% хромосомной ДНК представлено гуанином и цитозином.
У Natronomonas pharaonis также была отмечена высокая доля кислых аминокислот в белках протеома (в среднем, 19,3%). Это расценивается в качестве адаптивной особенности данной археи: чтобы выжить в экстремально гипертонических условиях необходимо поддерживать высокую внутреннюю концентрацию солей. Кроме того следует отметить, что, поскольку данная архея не обладает генами, кодирующими ключевые ферменты гликолиза, она не способна расщеплять сахара.
*************************************************** PubMed FEMS Microbiol Ecol. 2010 Aug;73(2):271-7. Epub 2010 Apr 23.
UV photoreactions of the extremely haloalkaliphilic euryarchaeon Natronomonas pharaonis.
Moeller R, Reitz G, Douki T, Cadet J, Horneck G, Stan-Lotter H.
Radiation Biology Department, German Aerospace Center (DLR), Institute of Aerospace Medicine, Koln,
Germany. ralf.moeller@dlr.de
Abstract
The objective of this study was to investigate the photobiological responses of the haloalkaliphilic
euryarchaeon Natronomonas pharaonis to environmentally relevant polychromatic UV radiation, simulating
either the present UV radiation climate (lambda>290 nm) or that of the early Earth (lambda>220 nm), and to
monochromatic UVC radiation (lambda=254 nm) for comparison with the literature data. UV-induced bipyrimidine
DNA photoproducts were determined using a sensitive and accurate HPLC tandem mass spectrometry assay, allowing
to identify and quantify each type of photoproducts formed in the DNA of a UV-irradiated halophilic archaeon.
The thymine cytosine (TC) pyrimidine (6-4) pyrimidone photoproduct and the TC cyclobutane pyrimidine dimer
accounted for almost 80% of the total induced DNA photolesions, regardless of the wavelength range tested.
These prominent formation rates of TC photoproducts correlated with the genomic frequencies of TC dinucleotides
in N. pharaonis.
PMID: 20491923
************************************************************************************************************
Сведения о геноме и протеоме археи
